Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0C8

Vav3, Guanine nucleotide exchange factor VAV3, mousemouse

Predictions only

Length 847 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav3Q9R0C8 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vav3Q9R0C8 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vav3Q9R0C8 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Vav3Q9R0C8 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vav3Q9R0C8 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vav3Q9R0C8 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vav3Q9R0C8 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vav3Q9R0C8 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vav3Q9R0C8 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vav3Q9R0C8 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vav3Q9R0C8 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vav3Q9R0C8 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vav3Q9R0C8 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vav3Q9R0C8 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vav3Q9R0C8 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vav3Q9R0C8 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vav3Q9R0C8 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vav3Q9R0C8 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vav3Q9R0C8 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vav3Q9R0C8 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vav3Q9R0C8 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vav3Q9R0C8 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Vav3Q9R0C8 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vav3Q9R0C8 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Vav3Q9R0C8 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Vav3Q9R0C8 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Vav3Q9R0C8 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vav3Q9R0C8 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vav3Q9R0C8 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Vav3Q9R0C8 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vav3Q9R0C8 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Vav3Q9R0C8 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vav3Q9R0C8 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vav3Q9R0C8 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vav3Q9R0C8 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vav3Q9R0C8 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vav3Q9R0C8 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vav3Q9R0C8 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vav3Q9R0C8 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vav3Q9R0C8 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vav3Q9R0C8 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vav3Q9R0C8 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vav3Q9R0C8 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vav3Q9R0C8 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vav3Q9R0C8 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vav3Q9R0C8 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vav3Q9R0C8 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vav3Q9R0C8 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vav3Q9R0C8 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vav3Q9R0C8 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vav3Q9R0C8 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vav3Q9R0C8 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vav3Q9R0C8 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vav3Q9R0C8 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vav3Q9R0C8 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vav3Q9R0C8 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vav3Q9R0C8 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vav3Q9R0C8 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vav3Q9R0C8 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vav3Q9R0C8 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vav3Q9R0C8 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Vav3Q9R0C8 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vav3Q9R0C8 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vav3Q9R0C8 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Vav3Q9R0C8 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Vav3Q9R0C8 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vav3Q9R0C8 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Vav3Q9R0C8 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vav3Q9R0C8 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vav3Q9R0C8 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vav3Q9R0C8 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vav3Q9R0C8 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vav3Q9R0C8 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vav3Q9R0C8 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vav3Q9R0C8 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vav3Q9R0C8 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vav3Q9R0C8 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vav3Q9R0C8 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vav3Q9R0C8 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vav3Q9R0C8 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vav3Q9R0C8 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vav3Q9R0C8 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vav3Q9R0C8 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vav3Q9R0C8 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
Vav3Q9R0C8 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vav3Q9R0C8 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vav3Q9R0C8 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vav3Q9R0C8 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vav3Q9R0C8 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vav3Q9R0C8 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vav3Q9R0C8 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vav3Q9R0C8 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vav3Q9R0C8 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vav3Q9R0C8 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vav3Q9R0C8 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vav3Q9R0C8 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vav3Q9R0C8 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Vav3Q9R0C8 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vav3Q9R0C8 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Vav3Q9R0C8 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.1 ms