Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnf4Q9QZS2 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnf4Q9QZS2 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnf4Q9QZS2 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnf4Q9QZS2 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnf4Q9QZS2 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnf4Q9QZS2 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnf4Q9QZS2 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnf4Q9QZS2 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnf4Q9QZS2 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnf4Q9QZS2 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnf4Q9QZS2 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnf4Q9QZS2 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnf4Q9QZS2 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnf4Q9QZS2 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnf4Q9QZS2 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnf4Q9QZS2 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rnf4Q9QZS2 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rnf4Q9QZS2 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rnf4Q9QZS2 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rnf4Q9QZS2 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rnf4Q9QZS2 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rnf4Q9QZS2 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rnf4Q9QZS2 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rnf4Q9QZS2 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rnf4Q9QZS2 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rnf4Q9QZS2 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf4Q9QZS2 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf4Q9QZS2 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf4Q9QZS2 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf4Q9QZS2 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf4Q9QZS2 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf4Q9QZS2 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf4Q9QZS2 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf4Q9QZS2 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf4Q9QZS2 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf4Q9QZS2 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf4Q9QZS2 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf4Q9QZS2 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf4Q9QZS2 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf4Q9QZS2 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf4Q9QZS2 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf4Q9QZS2 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf4Q9QZS2 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf4Q9QZS2 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf4Q9QZS2 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf4Q9QZS2 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf4Q9QZS2 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf4Q9QZS2 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf4Q9QZS2 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf4Q9QZS2 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf4Q9QZS2 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf4Q9QZS2 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf4Q9QZS2 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf4Q9QZS2 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf4Q9QZS2 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf4Q9QZS2 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf4Q9QZS2 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf4Q9QZS2 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf4Q9QZS2 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf4Q9QZS2 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf4Q9QZS2 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf4Q9QZS2 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf4Q9QZS2 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf4Q9QZS2 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf4Q9QZS2 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf4Q9QZS2 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf4Q9QZS2 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf4Q9QZS2 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf4Q9QZS2 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf4Q9QZS2 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf4Q9QZS2 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf4Q9QZS2 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf4Q9QZS2 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf4Q9QZS2 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf4Q9QZS2 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf4Q9QZS2 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf4Q9QZS2 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf4Q9QZS2 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf4Q9QZS2 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf4Q9QZS2 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf4Q9QZS2 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf4Q9QZS2 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf4Q9QZS2 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf4Q9QZS2 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf4Q9QZS2 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf4Q9QZS2 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf4Q9QZS2 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf4Q9QZS2 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf4Q9QZS2 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf4Q9QZS2 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf4Q9QZS2 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf4Q9QZS2 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf4Q9QZS2 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf4Q9QZS2 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf4Q9QZS2 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf4Q9QZS2 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf4Q9QZS2 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf4Q9QZS2 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf4Q9QZS2 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms