Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ09

Phtf1, Putative homeodomain transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 761 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf1Q9QZ09 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Phtf1Q9QZ09 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Phtf1Q9QZ09 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Phtf1Q9QZ09 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Phtf1Q9QZ09 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Phtf1Q9QZ09 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Phtf1Q9QZ09 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Phtf1Q9QZ09 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Phtf1Q9QZ09 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Phtf1Q9QZ09 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Phtf1Q9QZ09 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Phtf1Q9QZ09 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Phtf1Q9QZ09 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Phtf1Q9QZ09 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Phtf1Q9QZ09 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Phtf1Q9QZ09 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Phtf1Q9QZ09 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Phtf1Q9QZ09 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Phtf1Q9QZ09 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Phtf1Q9QZ09 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Phtf1Q9QZ09 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Phtf1Q9QZ09 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Phtf1Q9QZ09 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Phtf1Q9QZ09 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Phtf1Q9QZ09 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Phtf1Q9QZ09 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Phtf1Q9QZ09 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Phtf1Q9QZ09 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Phtf1Q9QZ09 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Phtf1Q9QZ09 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Phtf1Q9QZ09 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Phtf1Q9QZ09 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Phtf1Q9QZ09 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Phtf1Q9QZ09 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Phtf1Q9QZ09 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Phtf1Q9QZ09 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Phtf1Q9QZ09 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Phtf1Q9QZ09 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Phtf1Q9QZ09 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Phtf1Q9QZ09 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Phtf1Q9QZ09 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Phtf1Q9QZ09 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Phtf1Q9QZ09 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Phtf1Q9QZ09 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Phtf1Q9QZ09 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Phtf1Q9QZ09 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Phtf1Q9QZ09 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Phtf1Q9QZ09 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Phtf1Q9QZ09 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Phtf1Q9QZ09 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Phtf1Q9QZ09 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Phtf1Q9QZ09 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Phtf1Q9QZ09 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Phtf1Q9QZ09 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Phtf1Q9QZ09 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Phtf1Q9QZ09 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Phtf1Q9QZ09 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Phtf1Q9QZ09 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Phtf1Q9QZ09 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Phtf1Q9QZ09 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Phtf1Q9QZ09 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Phtf1Q9QZ09 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Phtf1Q9QZ09 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Phtf1Q9QZ09 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Phtf1Q9QZ09 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Phtf1Q9QZ09 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Phtf1Q9QZ09 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Phtf1Q9QZ09 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Phtf1Q9QZ09 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Phtf1Q9QZ09 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Phtf1Q9QZ09 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Phtf1Q9QZ09 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Phtf1Q9QZ09 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Phtf1Q9QZ09 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Phtf1Q9QZ09 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Phtf1Q9QZ09 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Phtf1Q9QZ09 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Phtf1Q9QZ09 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Phtf1Q9QZ09 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Phtf1Q9QZ09 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Phtf1Q9QZ09 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Phtf1Q9QZ09 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Phtf1Q9QZ09 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Phtf1Q9QZ09 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Phtf1Q9QZ09 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Phtf1Q9QZ09 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Phtf1Q9QZ09 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Phtf1Q9QZ09 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Phtf1Q9QZ09 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Phtf1Q9QZ09 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Phtf1Q9QZ09 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Phtf1Q9QZ09 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Phtf1Q9QZ09 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Phtf1Q9QZ09 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Phtf1Q9QZ09 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Phtf1Q9QZ09 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Phtf1Q9QZ09 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Phtf1Q9QZ09 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Phtf1Q9QZ09 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Phtf1Q9QZ09 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms