Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
ChmQ9QXG2 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ChmQ9QXG2 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ChmQ9QXG2 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ChmQ9QXG2 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ChmQ9QXG2 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
ChmQ9QXG2 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ChmQ9QXG2 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ChmQ9QXG2 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ChmQ9QXG2 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ChmQ9QXG2 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ChmQ9QXG2 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ChmQ9QXG2 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ChmQ9QXG2 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ChmQ9QXG2 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ChmQ9QXG2 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ChmQ9QXG2 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ChmQ9QXG2 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ChmQ9QXG2 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ChmQ9QXG2 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
ChmQ9QXG2 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ChmQ9QXG2 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ChmQ9QXG2 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ChmQ9QXG2 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ChmQ9QXG2 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ChmQ9QXG2 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ChmQ9QXG2 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ChmQ9QXG2 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ChmQ9QXG2 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ChmQ9QXG2 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ChmQ9QXG2 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
ChmQ9QXG2 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
ChmQ9QXG2 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
ChmQ9QXG2 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ChmQ9QXG2 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ChmQ9QXG2 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ChmQ9QXG2 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ChmQ9QXG2 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ChmQ9QXG2 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ChmQ9QXG2 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ChmQ9QXG2 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ChmQ9QXG2 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ChmQ9QXG2 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ChmQ9QXG2 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ChmQ9QXG2 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ChmQ9QXG2 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
ChmQ9QXG2 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ChmQ9QXG2 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ChmQ9QXG2 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ChmQ9QXG2 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ChmQ9QXG2 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ChmQ9QXG2 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
ChmQ9QXG2 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ChmQ9QXG2 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ChmQ9QXG2 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ChmQ9QXG2 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
ChmQ9QXG2 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
ChmQ9QXG2 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ChmQ9QXG2 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ChmQ9QXG2 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ChmQ9QXG2 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
ChmQ9QXG2 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ChmQ9QXG2 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ChmQ9QXG2 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ChmQ9QXG2 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ChmQ9QXG2 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ChmQ9QXG2 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ChmQ9QXG2 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ChmQ9QXG2 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ChmQ9QXG2 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ChmQ9QXG2 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ChmQ9QXG2 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ChmQ9QXG2 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ChmQ9QXG2 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ChmQ9QXG2 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ChmQ9QXG2 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ChmQ9QXG2 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ChmQ9QXG2 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ChmQ9QXG2 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ChmQ9QXG2 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ChmQ9QXG2 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ChmQ9QXG2 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ChmQ9QXG2 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ChmQ9QXG2 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ChmQ9QXG2 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ChmQ9QXG2 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ChmQ9QXG2 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ChmQ9QXG2 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ChmQ9QXG2 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
ChmQ9QXG2 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ChmQ9QXG2 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
ChmQ9QXG2 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ChmQ9QXG2 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ChmQ9QXG2 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ChmQ9QXG2 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ChmQ9QXG2 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ChmQ9QXG2 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
ChmQ9QXG2 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
ChmQ9QXG2 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ChmQ9QXG2 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms