Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim44Q9QXA7 Kcnab2-207ENSMUST00000160884 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim44Q9QXA7 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim44Q9QXA7 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim44Q9QXA7 Ube3a-203ENSMUST00000200758 9856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim44Q9QXA7 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim44Q9QXA7 Hif1an-201ENSMUST00000040455 6194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim44Q9QXA7 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim44Q9QXA7 Egfr-201ENSMUST00000020329 10208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim44Q9QXA7 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim44Q9QXA7 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim44Q9QXA7 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim44Q9QXA7 Pear1-201ENSMUST00000029714 4260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim44Q9QXA7 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim44Q9QXA7 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim44Q9QXA7 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim44Q9QXA7 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim44Q9QXA7 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim44Q9QXA7 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim44Q9QXA7 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim44Q9QXA7 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim44Q9QXA7 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim44Q9QXA7 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim44Q9QXA7 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim44Q9QXA7 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim44Q9QXA7 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim44Q9QXA7 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim44Q9QXA7 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim44Q9QXA7 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim44Q9QXA7 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim44Q9QXA7 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim44Q9QXA7 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim44Q9QXA7 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim44Q9QXA7 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim44Q9QXA7 Cacna1e-207ENSMUST00000211821 6765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim44Q9QXA7 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim44Q9QXA7 Zdhhc3-208ENSMUST00000147563 6987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim44Q9QXA7 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim44Q9QXA7 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim44Q9QXA7 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim44Q9QXA7 Gm38901-201ENSMUST00000202448 3008 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim44Q9QXA7 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim44Q9QXA7 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim44Q9QXA7 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim44Q9QXA7 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim44Q9QXA7 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim44Q9QXA7 Zfp964-203ENSMUST00000204285 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim44Q9QXA7 Zfand2a-201ENSMUST00000079996 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Nup210-202ENSMUST00000113509 6893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Tgfb1i1-201ENSMUST00000070656 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Gm12296-201ENSMUST00000144922 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Specc1l-201ENSMUST00000040105 5928 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Sez6l-202ENSMUST00000079491 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Trim44Q9QXA7 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
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Trim44Q9QXA7 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Trim44Q9QXA7 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Llgl1-202ENSMUST00000108719 4268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Son-202ENSMUST00000114037 8399 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Gm45140-202ENSMUST00000204419 5061 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Ralgps1-205ENSMUST00000131298 6035 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Pcdh18-201ENSMUST00000035931 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Card14-202ENSMUST00000106250 4206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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