Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Vrk1-204ENSMUST00000220629 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Meig1-202ENSMUST00000115081 421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Rabgef1Q9JM13 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Rabgef1Q9JM13 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 AC154634.3-201ENSMUST00000224589 736 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Rabgef1Q9JM13 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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