Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tlr5Q9JLF7 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms