Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF6

Tgm1, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase K, mousemouse

Predictions only

Length 815 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm1Q9JLF6 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
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Tgm1Q9JLF6 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
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Tgm1Q9JLF6 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tgm1Q9JLF6 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
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Tgm1Q9JLF6 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Tgm1Q9JLF6 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tgm1Q9JLF6 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tgm1Q9JLF6 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tgm1Q9JLF6 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tgm1Q9JLF6 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tgm1Q9JLF6 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tgm1Q9JLF6 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
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Tgm1Q9JLF6 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
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Tgm1Q9JLF6 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tgm1Q9JLF6 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Tgm1Q9JLF6 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tgm1Q9JLF6 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Tgm1Q9JLF6 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Tgm1Q9JLF6 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Tgm1Q9JLF6 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Tgm1Q9JLF6 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tgm1Q9JLF6 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Tgm1Q9JLF6 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tgm1Q9JLF6 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Tgm1Q9JLF6 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Tgm1Q9JLF6 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tgm1Q9JLF6 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tgm1Q9JLF6 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tgm1Q9JLF6 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tgm1Q9JLF6 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Tgm1Q9JLF6 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tgm1Q9JLF6 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tgm1Q9JLF6 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tgm1Q9JLF6 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Tgm1Q9JLF6 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Tgm1Q9JLF6 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tgm1Q9JLF6 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tgm1Q9JLF6 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Tgm1Q9JLF6 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tgm1Q9JLF6 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms