Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC8

Sacs, Sacsin, mousemouse

Predictions only

Length 4,582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SacsQ9JLC8 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
SacsQ9JLC8 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
SacsQ9JLC8 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
SacsQ9JLC8 Krt33b-201ENSMUST00000073890 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
SacsQ9JLC8 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
SacsQ9JLC8 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
SacsQ9JLC8 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
SacsQ9JLC8 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
SacsQ9JLC8 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
SacsQ9JLC8 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
SacsQ9JLC8 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
SacsQ9JLC8 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
SacsQ9JLC8 Ntf3-203ENSMUST00000204542 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
SacsQ9JLC8 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
SacsQ9JLC8 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
SacsQ9JLC8 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
SacsQ9JLC8 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
SacsQ9JLC8 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
SacsQ9JLC8 Scp2-202ENSMUST00000106701 772 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
SacsQ9JLC8 Gm14630-201ENSMUST00000118057 246 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
SacsQ9JLC8 Myl1-203ENSMUST00000120415 621 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
SacsQ9JLC8 Gm11993-201ENSMUST00000121861 820 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
SacsQ9JLC8 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
SacsQ9JLC8 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
SacsQ9JLC8 Gm19918-201ENSMUST00000194858 400 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
SacsQ9JLC8 9530034A14Rik-201ENSMUST00000197919 1083 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
SacsQ9JLC8 Gm44939-201ENSMUST00000206939 814 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
SacsQ9JLC8 Gm31497-201ENSMUST00000216981 638 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
SacsQ9JLC8 AC122459.4-201ENSMUST00000228654 551 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
SacsQ9JLC8 Gemin8-203ENSMUST00000096252 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
SacsQ9JLC8 Prr16-201ENSMUST00000116639 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
SacsQ9JLC8 Olfr464-205ENSMUST00000217112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
SacsQ9JLC8 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
SacsQ9JLC8 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
SacsQ9JLC8 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
SacsQ9JLC8 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SacsQ9JLC8 Prim2-201ENSMUST00000027312 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
SacsQ9JLC8 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
SacsQ9JLC8 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
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SacsQ9JLC8 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
SacsQ9JLC8 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
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SacsQ9JLC8 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
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SacsQ9JLC8 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
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SacsQ9JLC8 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
SacsQ9JLC8 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
SacsQ9JLC8 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
SacsQ9JLC8 Lrit3-201ENSMUST00000179187 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SacsQ9JLC8 Gm17745-201ENSMUST00000212186 1692 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
SacsQ9JLC8 Slc25a17-201ENSMUST00000023040 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
SacsQ9JLC8 Msrb1-202ENSMUST00000115262 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
SacsQ9JLC8 Gm15033-201ENSMUST00000118188 673 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SacsQ9JLC8 Gm19013-201ENSMUST00000183895 1222 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SacsQ9JLC8 Gm19014-201ENSMUST00000184828 1189 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SacsQ9JLC8 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
SacsQ9JLC8 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
SacsQ9JLC8 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
SacsQ9JLC8 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
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