Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL95

Prg3, Proteoglycan 3, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg3Q9JL95 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prg3Q9JL95 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prg3Q9JL95 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prg3Q9JL95 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Prg3Q9JL95 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prg3Q9JL95 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prg3Q9JL95 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prg3Q9JL95 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prg3Q9JL95 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prg3Q9JL95 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prg3Q9JL95 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prg3Q9JL95 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prg3Q9JL95 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prg3Q9JL95 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prg3Q9JL95 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prg3Q9JL95 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prg3Q9JL95 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prg3Q9JL95 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prg3Q9JL95 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prg3Q9JL95 Hmgn2-201ENSMUST00000100472 881 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prg3Q9JL95 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Prg3Q9JL95 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prg3Q9JL95 Gm23675-201ENSMUST00000157311 125 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Prg3Q9JL95 Gm20822-201ENSMUST00000165756 687 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prg3Q9JL95 Gm20828-201ENSMUST00000170889 687 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prg3Q9JL95 4930578M01Rik-201ENSMUST00000180490 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prg3Q9JL95 Gm39397-201ENSMUST00000212331 228 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prg3Q9JL95 AC142266.1-201ENSMUST00000228107 415 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Prg3Q9JL95 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prg3Q9JL95 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prg3Q9JL95 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prg3Q9JL95 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prg3Q9JL95 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prg3Q9JL95 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prg3Q9JL95 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prg3Q9JL95 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prg3Q9JL95 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prg3Q9JL95 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prg3Q9JL95 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prg3Q9JL95 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prg3Q9JL95 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prg3Q9JL95 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prg3Q9JL95 9430015G10Rik-202ENSMUST00000105576 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prg3Q9JL95 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prg3Q9JL95 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prg3Q9JL95 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prg3Q9JL95 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prg3Q9JL95 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prg3Q9JL95 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prg3Q9JL95 Gm12337-201ENSMUST00000119634 400 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Prg3Q9JL95 Gm14034-201ENSMUST00000120147 551 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Prg3Q9JL95 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Prg3Q9JL95 Mir1905-201ENSMUST00000122779 82 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Prg3Q9JL95 Kdm6bos-201ENSMUST00000129924 840 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prg3Q9JL95 Gm11205-201ENSMUST00000137738 431 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prg3Q9JL95 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Prg3Q9JL95 Gm34379-201ENSMUST00000195036 290 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Prg3Q9JL95 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prg3Q9JL95 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prg3Q9JL95 AC138716.2-201ENSMUST00000226670 1016 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Prg3Q9JL95 Gm26670-202ENSMUST00000226862 340 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Prg3Q9JL95 Gm8181-201ENSMUST00000062242 669 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Prg3Q9JL95 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prg3Q9JL95 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prg3Q9JL95 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prg3Q9JL95 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prg3Q9JL95 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prg3Q9JL95 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Prg3Q9JL95 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Prg3Q9JL95 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Prg3Q9JL95 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Prg3Q9JL95 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Prg3Q9JL95 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Prg3Q9JL95 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Prg3Q9JL95 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Prg3Q9JL95 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Prg3Q9JL95 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prg3Q9JL95 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prg3Q9JL95 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prg3Q9JL95 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prg3Q9JL95 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prg3Q9JL95 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prg3Q9JL95 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prg3Q9JL95 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prg3Q9JL95 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Prg3Q9JL95 Ighv7-1-201ENSMUST00000103474 363 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prg3Q9JL95 Gm9166-201ENSMUST00000120293 561 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Prg3Q9JL95 Gm15911-201ENSMUST00000138992 809 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prg3Q9JL95 Polr3c-205ENSMUST00000141377 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prg3Q9JL95 Rps19-ps10-201ENSMUST00000159750 435 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Prg3Q9JL95 Gm16240-201ENSMUST00000161924 614 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prg3Q9JL95 Nmbr-207ENSMUST00000190751 921 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prg3Q9JL95 Ndufc1-204ENSMUST00000193279 315 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prg3Q9JL95 Gm30731-201ENSMUST00000203909 825 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prg3Q9JL95 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prg3Q9JL95 Gm4930-201ENSMUST00000219926 1087 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Prg3Q9JL95 Gm9791-201ENSMUST00000060997 447 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Prg3Q9JL95 Olfr372-201ENSMUST00000093434 1016 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prg3Q9JL95 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prg3Q9JL95 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.6 ms