Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gde1Q9JL56 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 Gm25951-201ENSMUST00000175330 64 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 Nras-208ENSMUST00000200069 831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 Taar8b-201ENSMUST00000092654 1035 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 Gm5544-201ENSMUST00000098828 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 Gm13600-201ENSMUST00000117949 744 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 1700008A23Rik-201ENSMUST00000191694 691 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 2310074N15Rik-201ENSMUST00000198276 582 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms