Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
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