Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE2

Trem1, Triggering receptor expressed on myeloid cells 1, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem1Q9JKE2 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 Gtf2ird1-206ENSMUST00000111244 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 Mov10-203ENSMUST00000106775 3584 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 Mov10-206ENSMUST00000166979 3584 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 Arhgap24-205ENSMUST00000112853 2853 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 Ttll7-205ENSMUST00000170055 6075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 Slc2a4rg-ps-201ENSMUST00000127559 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 Cnr2-202ENSMUST00000097843 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 Gfm2-201ENSMUST00000022170 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 Tcn2-206ENSMUST00000109992 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 H2-M10.3-201ENSMUST00000073546 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 Mcm3-201ENSMUST00000053266 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 Top3a-204ENSMUST00000120417 2318 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 Slc6a2-201ENSMUST00000072939 6187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 Hdac9-206ENSMUST00000209990 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 Ovgp1-201ENSMUST00000000573 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 Ppp2r2a-201ENSMUST00000089230 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 Tia1-201ENSMUST00000095752 3130 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 Olfr1199-204ENSMUST00000213138 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 Mapkap1-203ENSMUST00000113126 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 Mlxipl-201ENSMUST00000005507 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 Duoxa1-203ENSMUST00000110538 2467 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 Anapc15-213ENSMUST00000178851 2797 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trem1Q9JKE2 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trem1Q9JKE2 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trem1Q9JKE2 AC121574.1-201ENSMUST00000228770 3132 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Trem1Q9JKE2 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trem1Q9JKE2 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trem1Q9JKE2 Krba1-201ENSMUST00000031815 3685 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trem1Q9JKE2 Atp1a2-202ENSMUST00000097464 3186 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trem1Q9JKE2 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trem1Q9JKE2 Trem1-201ENSMUST00000048782 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trem1Q9JKE2 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trem1Q9JKE2 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trem1Q9JKE2 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trem1Q9JKE2 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trem1Q9JKE2 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Trem1Q9JKE2 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Trem1Q9JKE2 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trem1Q9JKE2 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trem1Q9JKE2 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms