Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES61

Ms4a4b, Chandra protein, mousemouse

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Length 226 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4bQ9ES61 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ms4a4bQ9ES61 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ms4a4bQ9ES61 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ms4a4bQ9ES61 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ms4a4bQ9ES61 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Ms4a4bQ9ES61 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ms4a4bQ9ES61 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ms4a4bQ9ES61 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ms4a4bQ9ES61 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ms4a4bQ9ES61 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Ms4a4bQ9ES61 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ms4a4bQ9ES61 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ms4a4bQ9ES61 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ms4a4bQ9ES61 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ms4a4bQ9ES61 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ms4a4bQ9ES61 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ms4a4bQ9ES61 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ms4a4bQ9ES61 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ms4a4bQ9ES61 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ms4a4bQ9ES61 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Ms4a4bQ9ES61 Olfr1082-201ENSMUST00000215600 1620 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ms4a4bQ9ES61 Gm7861-201ENSMUST00000110749 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ms4a4bQ9ES61 Vmn1r-ps126-201ENSMUST00000117681 926 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Ms4a4bQ9ES61 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Ms4a4bQ9ES61 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Ms4a4bQ9ES61 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Ms4a4bQ9ES61 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Ms4a4bQ9ES61 Gm14257-201ENSMUST00000144649 765 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ms4a4bQ9ES61 Gm15600-201ENSMUST00000153522 856 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ms4a4bQ9ES61 Med6-205ENSMUST00000161598 897 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ms4a4bQ9ES61 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ms4a4bQ9ES61 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ms4a4bQ9ES61 4831440E17Rik-201ENSMUST00000181942 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ms4a4bQ9ES61 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Ms4a4bQ9ES61 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ms4a4bQ9ES61 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ms4a4bQ9ES61 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ms4a4bQ9ES61 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ms4a4bQ9ES61 Gm43664-201ENSMUST00000196038 734 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Ms4a4bQ9ES61 Gm44395-201ENSMUST00000197056 153 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Ms4a4bQ9ES61 Gtpbp4-ps7-201ENSMUST00000197059 297 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Ms4a4bQ9ES61 Gm18422-201ENSMUST00000203663 1032 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Ms4a4bQ9ES61 Gm18988-201ENSMUST00000205601 746 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Ms4a4bQ9ES61 Olfr1335-202ENSMUST00000219094 1148 ntAPPRIS P2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ms4a4bQ9ES61 Smim15-203ENSMUST00000224361 830 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ms4a4bQ9ES61 Pcgf5-204ENSMUST00000224772 1266 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ms4a4bQ9ES61 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ms4a4bQ9ES61 Olfr1335-201ENSMUST00000084313 1148 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ms4a4bQ9ES61 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ms4a4bQ9ES61 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ms4a4bQ9ES61 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ms4a4bQ9ES61 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ms4a4bQ9ES61 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Ms4a4bQ9ES61 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ms4a4bQ9ES61 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ms4a4bQ9ES61 CT009713.5-203ENSMUST00000224218 2079 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Ms4a4bQ9ES61 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ms4a4bQ9ES61 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ms4a4bQ9ES61 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Ms4a4bQ9ES61 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ms4a4bQ9ES61 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ms4a4bQ9ES61 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ms4a4bQ9ES61 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ms4a4bQ9ES61 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ms4a4bQ9ES61 4921534H16Rik-201ENSMUST00000162370 1392 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ms4a4bQ9ES61 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ms4a4bQ9ES61 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ms4a4bQ9ES61 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ms4a4bQ9ES61 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ms4a4bQ9ES61 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ms4a4bQ9ES61 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ms4a4bQ9ES61 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ms4a4bQ9ES61 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ms4a4bQ9ES61 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ms4a4bQ9ES61 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ms4a4bQ9ES61 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ms4a4bQ9ES61 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ms4a4bQ9ES61 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ms4a4bQ9ES61 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ms4a4bQ9ES61 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ms4a4bQ9ES61 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ms4a4bQ9ES61 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Ms4a4bQ9ES61 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ms4a4bQ9ES61 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ms4a4bQ9ES61 Smim9-201ENSMUST00000101433 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ms4a4bQ9ES61 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Ms4a4bQ9ES61 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ms4a4bQ9ES61 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ms4a4bQ9ES61 Acbd7-201ENSMUST00000115089 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ms4a4bQ9ES61 Gm11854-201ENSMUST00000117839 446 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Ms4a4bQ9ES61 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ms4a4bQ9ES61 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ms4a4bQ9ES61 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Ms4a4bQ9ES61 Gm44501-201ENSMUST00000167713 1229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ms4a4bQ9ES61 Gm17258-201ENSMUST00000168462 1266 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Ms4a4bQ9ES61 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Ms4a4bQ9ES61 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Ms4a4bQ9ES61 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ms4a4bQ9ES61 Gm8521-201ENSMUST00000190394 606 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Ms4a4bQ9ES61 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms