Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERF3

Wdr61, WD repeat-containing protein 61, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr61Q9ERF3 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Ppp1r10-201ENSMUST00000087210 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Myo9a-205ENSMUST00000135298 12198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Cabin1-201ENSMUST00000001712 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Arhgef10-202ENSMUST00000110800 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Bcl9l-203ENSMUST00000218183 6771 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Gm45140-202ENSMUST00000204419 5061 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Ccdc24-206ENSMUST00000164853 3990 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Gm19040-201ENSMUST00000203280 4726 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Hif1an-201ENSMUST00000040455 6194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms