Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER00

Stx12, Syntaxin-12, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx12Q9ER00 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Stx12Q9ER00 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Stx12Q9ER00 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Stx12Q9ER00 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Stx12Q9ER00 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Stx12Q9ER00 Smad9-201ENSMUST00000029371 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Stx12Q9ER00 Pou6f1-204ENSMUST00000176271 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Stx12Q9ER00 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Stx12Q9ER00 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Stx12Q9ER00 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Stx12Q9ER00 Gria4-202ENSMUST00000063508 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Stx12Q9ER00 Zdhhc3-208ENSMUST00000147563 6987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Stx12Q9ER00 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Stx12Q9ER00 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Stx12Q9ER00 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Stx12Q9ER00 Stard4-201ENSMUST00000025236 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Stx12Q9ER00 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Stx12Q9ER00 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Stx12Q9ER00 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Stx12Q9ER00 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Stx12Q9ER00 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Stx12Q9ER00 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Stx12Q9ER00 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Stx12Q9ER00 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Stx12Q9ER00 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Stx12Q9ER00 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Stx12Q9ER00 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Stx12Q9ER00 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Stx12Q9ER00 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Stx12Q9ER00 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Stx12Q9ER00 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Stx12Q9ER00 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Stx12Q9ER00 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Stx12Q9ER00 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Stx12Q9ER00 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Stx12Q9ER00 Hcrtr2-203ENSMUST00000184757 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Stx12Q9ER00 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Stx12Q9ER00 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Stx12Q9ER00 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Stx12Q9ER00 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Stx12Q9ER00 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Stx12Q9ER00 Svil-211ENSMUST00000143254 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Stx12Q9ER00 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Stx12Q9ER00 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Stx12Q9ER00 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Stx12Q9ER00 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Stx12Q9ER00 Kalrn-205ENSMUST00000114953 4722 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Stx12Q9ER00 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Stx12Q9ER00 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Stx12Q9ER00 Peg3-201ENSMUST00000051209 8694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Stx12Q9ER00 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Stx12Q9ER00 Slc6a2-201ENSMUST00000072939 6187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Stx12Q9ER00 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Stx12Q9ER00 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Stx12Q9ER00 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Stx12Q9ER00 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Stx12Q9ER00 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Stx12Q9ER00 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Stx12Q9ER00 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Stx12Q9ER00 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Stx12Q9ER00 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Stx12Q9ER00 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Stx12Q9ER00 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Stx12Q9ER00 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Stx12Q9ER00 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Stx12Q9ER00 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Stx12Q9ER00 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Stx12Q9ER00 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Stx12Q9ER00 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Stx12Q9ER00 Invs-201ENSMUST00000030029 5633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Stx12Q9ER00 Tardbp-209ENSMUST00000165113 6495 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Stx12Q9ER00 Scrn1-201ENSMUST00000019268 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Stx12Q9ER00 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Stx12Q9ER00 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Stx12Q9ER00 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Stx12Q9ER00 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Stx12Q9ER00 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Stx12Q9ER00 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Stx12Q9ER00 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Stx12Q9ER00 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Stx12Q9ER00 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Stx12Q9ER00 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Stx12Q9ER00 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Stx12Q9ER00 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Stx12Q9ER00 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Stx12Q9ER00 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Stx12Q9ER00 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Stx12Q9ER00 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Stx12Q9ER00 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Stx12Q9ER00 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Stx12Q9ER00 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Stx12Q9ER00 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Stx12Q9ER00 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Stx12Q9ER00 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Stx12Q9ER00 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Stx12Q9ER00 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Stx12Q9ER00 Mthfr-201ENSMUST00000069604 6072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Stx12Q9ER00 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Stx12Q9ER00 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Stx12Q9ER00 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms