Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms