Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Gm15063-201ENSMUST00000152648 895 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 B230112I24Rik-201ENSMUST00000203953 1229 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Olfr1248-201ENSMUST00000216129 1078 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 CT009754.4-201ENSMUST00000221430 565 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Gm14667-201ENSMUST00000119448 1350 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Gm12439-201ENSMUST00000117162 365 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Gm14542-201ENSMUST00000118460 1248 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 C130071C03Rik-203ENSMUST00000182788 1368 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smg9Q9DB90 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms