Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pop5Q9DB28 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pop5Q9DB28 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Pop5Q9DB28 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pop5Q9DB28 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pop5Q9DB28 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pop5Q9DB28 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pop5Q9DB28 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pop5Q9DB28 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pop5Q9DB28 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pop5Q9DB28 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pop5Q9DB28 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pop5Q9DB28 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pop5Q9DB28 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Pop5Q9DB28 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pop5Q9DB28 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pop5Q9DB28 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pop5Q9DB28 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pop5Q9DB28 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pop5Q9DB28 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pop5Q9DB28 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pop5Q9DB28 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pop5Q9DB28 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Pop5Q9DB28 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pop5Q9DB28 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Pop5Q9DB28 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pop5Q9DB28 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pop5Q9DB28 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pop5Q9DB28 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pop5Q9DB28 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pop5Q9DB28 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pop5Q9DB28 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pop5Q9DB28 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pop5Q9DB28 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pop5Q9DB28 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Pop5Q9DB28 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pop5Q9DB28 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pop5Q9DB28 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pop5Q9DB28 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pop5Q9DB28 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pop5Q9DB28 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pop5Q9DB28 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pop5Q9DB28 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pop5Q9DB28 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Pop5Q9DB28 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pop5Q9DB28 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pop5Q9DB28 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pop5Q9DB28 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
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