Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAT5

Trmu, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrmuQ9DAT5 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TrmuQ9DAT5 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TrmuQ9DAT5 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TrmuQ9DAT5 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TrmuQ9DAT5 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TrmuQ9DAT5 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TrmuQ9DAT5 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TrmuQ9DAT5 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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TrmuQ9DAT5 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TrmuQ9DAT5 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
TrmuQ9DAT5 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TrmuQ9DAT5 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TrmuQ9DAT5 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TrmuQ9DAT5 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TrmuQ9DAT5 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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TrmuQ9DAT5 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TrmuQ9DAT5 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TrmuQ9DAT5 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TrmuQ9DAT5 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TrmuQ9DAT5 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TrmuQ9DAT5 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TrmuQ9DAT5 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TrmuQ9DAT5 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TrmuQ9DAT5 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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TrmuQ9DAT5 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
TrmuQ9DAT5 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TrmuQ9DAT5 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TrmuQ9DAT5 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TrmuQ9DAT5 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TrmuQ9DAT5 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TrmuQ9DAT5 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TrmuQ9DAT5 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TrmuQ9DAT5 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TrmuQ9DAT5 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TrmuQ9DAT5 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TrmuQ9DAT5 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
TrmuQ9DAT5 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TrmuQ9DAT5 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TrmuQ9DAT5 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TrmuQ9DAT5 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TrmuQ9DAT5 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TrmuQ9DAT5 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TrmuQ9DAT5 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
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TrmuQ9DAT5 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TrmuQ9DAT5 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TrmuQ9DAT5 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TrmuQ9DAT5 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
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TrmuQ9DAT5 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TrmuQ9DAT5 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TrmuQ9DAT5 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TrmuQ9DAT5 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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TrmuQ9DAT5 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TrmuQ9DAT5 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TrmuQ9DAT5 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TrmuQ9DAT5 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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TrmuQ9DAT5 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TrmuQ9DAT5 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TrmuQ9DAT5 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TrmuQ9DAT5 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TrmuQ9DAT5 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TrmuQ9DAT5 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TrmuQ9DAT5 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TrmuQ9DAT5 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
TrmuQ9DAT5 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
TrmuQ9DAT5 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TrmuQ9DAT5 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TrmuQ9DAT5 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TrmuQ9DAT5 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
TrmuQ9DAT5 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
TrmuQ9DAT5 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
TrmuQ9DAT5 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TrmuQ9DAT5 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TrmuQ9DAT5 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TrmuQ9DAT5 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
TrmuQ9DAT5 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
TrmuQ9DAT5 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
TrmuQ9DAT5 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
TrmuQ9DAT5 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
TrmuQ9DAT5 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TrmuQ9DAT5 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TrmuQ9DAT5 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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