Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M9

Rnf138rt1, RIKEN cDNA 1700045I19, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rnf138rt1Q9D9M9 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rnf138rt1Q9D9M9 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rnf138rt1Q9D9M9 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rnf138rt1Q9D9M9 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rnf138rt1Q9D9M9 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rnf138rt1Q9D9M9 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rnf138rt1Q9D9M9 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Rnf138rt1Q9D9M9 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rnf138rt1Q9D9M9 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Rnf138rt1Q9D9M9 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rnf138rt1Q9D9M9 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rnf138rt1Q9D9M9 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rnf138rt1Q9D9M9 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rnf138rt1Q9D9M9 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rnf138rt1Q9D9M9 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rnf138rt1Q9D9M9 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rnf138rt1Q9D9M9 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rnf138rt1Q9D9M9 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rnf138rt1Q9D9M9 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Rnf138rt1Q9D9M9 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Rnf138rt1Q9D9M9 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rnf138rt1Q9D9M9 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rnf138rt1Q9D9M9 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rnf138rt1Q9D9M9 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rnf138rt1Q9D9M9 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Rnf138rt1Q9D9M9 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rnf138rt1Q9D9M9 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnf138rt1Q9D9M9 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnf138rt1Q9D9M9 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnf138rt1Q9D9M9 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnf138rt1Q9D9M9 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnf138rt1Q9D9M9 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnf138rt1Q9D9M9 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnf138rt1Q9D9M9 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnf138rt1Q9D9M9 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnf138rt1Q9D9M9 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnf138rt1Q9D9M9 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnf138rt1Q9D9M9 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnf138rt1Q9D9M9 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnf138rt1Q9D9M9 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnf138rt1Q9D9M9 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnf138rt1Q9D9M9 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnf138rt1Q9D9M9 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnf138rt1Q9D9M9 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnf138rt1Q9D9M9 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnf138rt1Q9D9M9 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnf138rt1Q9D9M9 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnf138rt1Q9D9M9 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnf138rt1Q9D9M9 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnf138rt1Q9D9M9 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnf138rt1Q9D9M9 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnf138rt1Q9D9M9 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnf138rt1Q9D9M9 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnf138rt1Q9D9M9 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnf138rt1Q9D9M9 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnf138rt1Q9D9M9 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnf138rt1Q9D9M9 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnf138rt1Q9D9M9 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnf138rt1Q9D9M9 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnf138rt1Q9D9M9 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnf138rt1Q9D9M9 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnf138rt1Q9D9M9 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnf138rt1Q9D9M9 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnf138rt1Q9D9M9 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnf138rt1Q9D9M9 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnf138rt1Q9D9M9 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnf138rt1Q9D9M9 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnf138rt1Q9D9M9 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnf138rt1Q9D9M9 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnf138rt1Q9D9M9 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnf138rt1Q9D9M9 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnf138rt1Q9D9M9 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnf138rt1Q9D9M9 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnf138rt1Q9D9M9 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnf138rt1Q9D9M9 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnf138rt1Q9D9M9 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnf138rt1Q9D9M9 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnf138rt1Q9D9M9 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnf138rt1Q9D9M9 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnf138rt1Q9D9M9 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnf138rt1Q9D9M9 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms