Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Gtf3c6Q9D8P7 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Gtf3c6Q9D8P7 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 Traf1-207ENSMUST00000172159 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Gtf3c6Q9D8P7 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Gtf3c6Q9D8P7 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Gtf3c6Q9D8P7 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 Tnfrsf9-205ENSMUST00000116257 2115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Gtf3c6Q9D8P7 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Gtf3c6Q9D8P7 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Gtf3c6Q9D8P7 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Gtf3c6Q9D8P7 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 Syncrip-207ENSMUST00000174269 3286 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 Sp3-201ENSMUST00000066003 3808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 Ppp1r12a-205ENSMUST00000219263 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 Gm6098-201ENSMUST00000180234 330 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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