Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8N6

Lin37, Protein lin-37 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin37Q9D8N6 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 Bahcc1-203ENSMUST00000122148 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lin37Q9D8N6 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms