Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B3

Chmp4b, Charged multivesicular body protein 4b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4bQ9D8B3 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chmp4bQ9D8B3 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chmp4bQ9D8B3 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Chmp4bQ9D8B3 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chmp4bQ9D8B3 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chmp4bQ9D8B3 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chmp4bQ9D8B3 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chmp4bQ9D8B3 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chmp4bQ9D8B3 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chmp4bQ9D8B3 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Chmp4bQ9D8B3 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Chmp4bQ9D8B3 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Chmp4bQ9D8B3 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chmp4bQ9D8B3 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chmp4bQ9D8B3 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chmp4bQ9D8B3 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chmp4bQ9D8B3 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chmp4bQ9D8B3 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chmp4bQ9D8B3 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chmp4bQ9D8B3 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chmp4bQ9D8B3 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chmp4bQ9D8B3 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chmp4bQ9D8B3 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chmp4bQ9D8B3 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chmp4bQ9D8B3 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chmp4bQ9D8B3 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chmp4bQ9D8B3 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chmp4bQ9D8B3 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chmp4bQ9D8B3 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Chmp4bQ9D8B3 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chmp4bQ9D8B3 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chmp4bQ9D8B3 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chmp4bQ9D8B3 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chmp4bQ9D8B3 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chmp4bQ9D8B3 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chmp4bQ9D8B3 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chmp4bQ9D8B3 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chmp4bQ9D8B3 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chmp4bQ9D8B3 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chmp4bQ9D8B3 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chmp4bQ9D8B3 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chmp4bQ9D8B3 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chmp4bQ9D8B3 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chmp4bQ9D8B3 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Chmp4bQ9D8B3 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Chmp4bQ9D8B3 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Chmp4bQ9D8B3 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chmp4bQ9D8B3 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chmp4bQ9D8B3 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chmp4bQ9D8B3 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Chmp4bQ9D8B3 Pde1c-201ENSMUST00000044505 3907 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chmp4bQ9D8B3 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chmp4bQ9D8B3 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chmp4bQ9D8B3 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chmp4bQ9D8B3 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chmp4bQ9D8B3 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chmp4bQ9D8B3 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chmp4bQ9D8B3 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chmp4bQ9D8B3 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chmp4bQ9D8B3 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chmp4bQ9D8B3 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chmp4bQ9D8B3 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chmp4bQ9D8B3 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chmp4bQ9D8B3 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chmp4bQ9D8B3 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chmp4bQ9D8B3 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chmp4bQ9D8B3 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chmp4bQ9D8B3 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Chmp4bQ9D8B3 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chmp4bQ9D8B3 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chmp4bQ9D8B3 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chmp4bQ9D8B3 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chmp4bQ9D8B3 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chmp4bQ9D8B3 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Chmp4bQ9D8B3 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chmp4bQ9D8B3 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chmp4bQ9D8B3 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chmp4bQ9D8B3 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chmp4bQ9D8B3 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chmp4bQ9D8B3 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chmp4bQ9D8B3 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chmp4bQ9D8B3 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chmp4bQ9D8B3 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Chmp4bQ9D8B3 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chmp4bQ9D8B3 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chmp4bQ9D8B3 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chmp4bQ9D8B3 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chmp4bQ9D8B3 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chmp4bQ9D8B3 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chmp4bQ9D8B3 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chmp4bQ9D8B3 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chmp4bQ9D8B3 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chmp4bQ9D8B3 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chmp4bQ9D8B3 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chmp4bQ9D8B3 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chmp4bQ9D8B3 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Chmp4bQ9D8B3 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chmp4bQ9D8B3 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Chmp4bQ9D8B3 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chmp4bQ9D8B3 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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