Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Cldn22Q9D7U6 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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