Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J7

Capns2, Calpain small subunit 2, mousemouse

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns2Q9D7J7 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Capns2Q9D7J7 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Capns2Q9D7J7 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Capns2Q9D7J7 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Capns2Q9D7J7 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Capns2Q9D7J7 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Capns2Q9D7J7 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Capns2Q9D7J7 Atp5s-204ENSMUST00000220916 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Capns2Q9D7J7 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Capns2Q9D7J7 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Capns2Q9D7J7 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Capns2Q9D7J7 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Capns2Q9D7J7 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Capns2Q9D7J7 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Capns2Q9D7J7 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Capns2Q9D7J7 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Capns2Q9D7J7 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Capns2Q9D7J7 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Capns2Q9D7J7 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Capns2Q9D7J7 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Capns2Q9D7J7 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Capns2Q9D7J7 Rpl13-ps4-201ENSMUST00000194776 628 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Capns2Q9D7J7 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Capns2Q9D7J7 Gm37197-201ENSMUST00000195607 401 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Capns2Q9D7J7 Gm45875-201ENSMUST00000212178 781 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Capns2Q9D7J7 Izumo1r-202ENSMUST00000069408 1172 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Capns2Q9D7J7 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Capns2Q9D7J7 2310016G11Rik-201ENSMUST00000094460 992 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Capns2Q9D7J7 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Capns2Q9D7J7 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Capns2Q9D7J7 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Capns2Q9D7J7 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Capns2Q9D7J7 Mocs2-216ENSMUST00000184672 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Capns2Q9D7J7 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Capns2Q9D7J7 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Capns2Q9D7J7 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Capns2Q9D7J7 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Capns2Q9D7J7 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Capns2Q9D7J7 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Capns2Q9D7J7 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Capns2Q9D7J7 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Capns2Q9D7J7 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Capns2Q9D7J7 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Capns2Q9D7J7 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Capns2Q9D7J7 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Capns2Q9D7J7 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Capns2Q9D7J7 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Capns2Q9D7J7 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Capns2Q9D7J7 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Capns2Q9D7J7 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Capns2Q9D7J7 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Capns2Q9D7J7 Unc119-202ENSMUST00000100755 933 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Capns2Q9D7J7 Gm9673-201ENSMUST00000119287 781 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Capns2Q9D7J7 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Capns2Q9D7J7 Gm14234-201ENSMUST00000119539 845 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Capns2Q9D7J7 Saxo2-202ENSMUST00000126478 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Capns2Q9D7J7 Gm25830-201ENSMUST00000158923 132 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Capns2Q9D7J7 Gm7211-201ENSMUST00000172692 1118 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Capns2Q9D7J7 Gm20471-201ENSMUST00000172793 626 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Capns2Q9D7J7 Gm24809-201ENSMUST00000175318 271 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Capns2Q9D7J7 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Capns2Q9D7J7 Gm29808-201ENSMUST00000194419 468 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Capns2Q9D7J7 Akr1c18-201ENSMUST00000021635 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Capns2Q9D7J7 Gm9791-201ENSMUST00000060997 447 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Capns2Q9D7J7 Taar7f-201ENSMUST00000071691 1077 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Capns2Q9D7J7 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Capns2Q9D7J7 Taar7d-201ENSMUST00000092657 1077 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Capns2Q9D7J7 Olfr372-201ENSMUST00000093434 1016 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Capns2Q9D7J7 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Capns2Q9D7J7 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Capns2Q9D7J7 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Capns2Q9D7J7 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Capns2Q9D7J7 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Capns2Q9D7J7 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Capns2Q9D7J7 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Capns2Q9D7J7 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Capns2Q9D7J7 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Capns2Q9D7J7 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Capns2Q9D7J7 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Capns2Q9D7J7 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Capns2Q9D7J7 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Capns2Q9D7J7 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Capns2Q9D7J7 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Capns2Q9D7J7 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Capns2Q9D7J7 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Cast-212ENSMUST00000223309 1529 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Gm12179-201ENSMUST00000118344 1272 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Gm14052-201ENSMUST00000121434 1031 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Kdm6bos-201ENSMUST00000129924 840 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms