Protein–RNA interactions for Protein: Q9D232

Spns3, Protein spinster homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spns3Q9D232 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Spns3Q9D232 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Spns3Q9D232 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Spns3Q9D232 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Spns3Q9D232 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Spns3Q9D232 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Spns3Q9D232 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Spns3Q9D232 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Spns3Q9D232 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Spns3Q9D232 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Spns3Q9D232 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Spns3Q9D232 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Spns3Q9D232 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Spns3Q9D232 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Spns3Q9D232 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Spns3Q9D232 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Spns3Q9D232 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Spns3Q9D232 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Spns3Q9D232 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Spns3Q9D232 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Spns3Q9D232 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Spns3Q9D232 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Spns3Q9D232 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Spns3Q9D232 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Spns3Q9D232 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Spns3Q9D232 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Spns3Q9D232 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Spns3Q9D232 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Spns3Q9D232 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Spns3Q9D232 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Spns3Q9D232 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Spns3Q9D232 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Spns3Q9D232 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Spns3Q9D232 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Spns3Q9D232 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Spns3Q9D232 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Spns3Q9D232 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Spns3Q9D232 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Spns3Q9D232 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Spns3Q9D232 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Spns3Q9D232 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Spns3Q9D232 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Spns3Q9D232 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Spns3Q9D232 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms