Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 AC207128.2-201ENSMUST00000223708 1924 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Gpcpd1-202ENSMUST00000060955 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Rxfp2-201ENSMUST00000065745 2539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Zfp617-201ENSMUST00000119003 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms