Protein–RNA interactions for Protein: Q9D071

Mms19, MMS19 nucleotide excision repair protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mms19Q9D071 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Mms19Q9D071 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Mms19Q9D071 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Mms19Q9D071 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Mms19Q9D071 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Mms19Q9D071 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Mms19Q9D071 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Mms19Q9D071 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Mms19Q9D071 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Mms19Q9D071 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Mms19Q9D071 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Mms19Q9D071 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Mms19Q9D071 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Mms19Q9D071 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Mms19Q9D071 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Mms19Q9D071 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Mms19Q9D071 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Mms19Q9D071 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Mms19Q9D071 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Mms19Q9D071 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Mms19Q9D071 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Mms19Q9D071 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Mms19Q9D071 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Mms19Q9D071 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Mms19Q9D071 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Mms19Q9D071 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Mms19Q9D071 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Mms19Q9D071 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Mms19Q9D071 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Mms19Q9D071 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Mms19Q9D071 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Mms19Q9D071 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Mms19Q9D071 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Mms19Q9D071 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Mms19Q9D071 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Mms19Q9D071 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Mms19Q9D071 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Mms19Q9D071 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Mms19Q9D071 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Mms19Q9D071 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Mms19Q9D071 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Mms19Q9D071 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Mms19Q9D071 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Mms19Q9D071 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Mms19Q9D071 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Mms19Q9D071 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Mms19Q9D071 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Mms19Q9D071 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Mms19Q9D071 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Mms19Q9D071 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mms19Q9D071 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mms19Q9D071 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mms19Q9D071 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mms19Q9D071 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mms19Q9D071 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mms19Q9D071 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mms19Q9D071 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Mms19Q9D071 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mms19Q9D071 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mms19Q9D071 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mms19Q9D071 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mms19Q9D071 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Mms19Q9D071 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Mms19Q9D071 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Mms19Q9D071 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Mms19Q9D071 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mms19Q9D071 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mms19Q9D071 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mms19Q9D071 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mms19Q9D071 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mms19Q9D071 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mms19Q9D071 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mms19Q9D071 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mms19Q9D071 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mms19Q9D071 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mms19Q9D071 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mms19Q9D071 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mms19Q9D071 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mms19Q9D071 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mms19Q9D071 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mms19Q9D071 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mms19Q9D071 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mms19Q9D071 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mms19Q9D071 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mms19Q9D071 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mms19Q9D071 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mms19Q9D071 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Mms19Q9D071 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mms19Q9D071 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mms19Q9D071 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mms19Q9D071 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mms19Q9D071 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mms19Q9D071 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mms19Q9D071 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Mms19Q9D071 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Mms19Q9D071 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Mms19Q9D071 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Mms19Q9D071 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Mms19Q9D071 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Mms19Q9D071 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.2 ms