Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXK8

Nip7, 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nip7Q9CXK8 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nip7Q9CXK8 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nip7Q9CXK8 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nip7Q9CXK8 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nip7Q9CXK8 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nip7Q9CXK8 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nip7Q9CXK8 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nip7Q9CXK8 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nip7Q9CXK8 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nip7Q9CXK8 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nip7Q9CXK8 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nip7Q9CXK8 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nip7Q9CXK8 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nip7Q9CXK8 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nip7Q9CXK8 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nip7Q9CXK8 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nip7Q9CXK8 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nip7Q9CXK8 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nip7Q9CXK8 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nip7Q9CXK8 Rnf181-212ENSMUST00000154098 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nip7Q9CXK8 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Nip7Q9CXK8 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Nip7Q9CXK8 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nip7Q9CXK8 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nip7Q9CXK8 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nip7Q9CXK8 AC154176.1-201ENSMUST00000225897 220 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Nip7Q9CXK8 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nip7Q9CXK8 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nip7Q9CXK8 Gm4744-201ENSMUST00000073642 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nip7Q9CXK8 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nip7Q9CXK8 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nip7Q9CXK8 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nip7Q9CXK8 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nip7Q9CXK8 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nip7Q9CXK8 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nip7Q9CXK8 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nip7Q9CXK8 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nip7Q9CXK8 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nip7Q9CXK8 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nip7Q9CXK8 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nip7Q9CXK8 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nip7Q9CXK8 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nip7Q9CXK8 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nip7Q9CXK8 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nip7Q9CXK8 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nip7Q9CXK8 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nip7Q9CXK8 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nip7Q9CXK8 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Nip7Q9CXK8 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nip7Q9CXK8 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nip7Q9CXK8 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Nip7Q9CXK8 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nip7Q9CXK8 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Nip7Q9CXK8 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Nip7Q9CXK8 Gm18059-201ENSMUST00000208073 580 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Nip7Q9CXK8 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nip7Q9CXK8 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Nip7Q9CXK8 Pbld1-206ENSMUST00000219687 788 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nip7Q9CXK8 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Nip7Q9CXK8 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Nip7Q9CXK8 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Nip7Q9CXK8 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Nip7Q9CXK8 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Nip7Q9CXK8 Sssca1-201ENSMUST00000025885 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nip7Q9CXK8 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Nip7Q9CXK8 Taar8b-201ENSMUST00000092654 1035 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nip7Q9CXK8 Gm5544-201ENSMUST00000098828 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nip7Q9CXK8 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nip7Q9CXK8 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nip7Q9CXK8 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nip7Q9CXK8 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nip7Q9CXK8 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nip7Q9CXK8 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nip7Q9CXK8 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nip7Q9CXK8 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nip7Q9CXK8 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nip7Q9CXK8 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Nip7Q9CXK8 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nip7Q9CXK8 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nip7Q9CXK8 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nip7Q9CXK8 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nip7Q9CXK8 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nip7Q9CXK8 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nip7Q9CXK8 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nip7Q9CXK8 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nip7Q9CXK8 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Nip7Q9CXK8 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Nip7Q9CXK8 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Nip7Q9CXK8 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nip7Q9CXK8 Bach2os-202ENSMUST00000136149 687 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nip7Q9CXK8 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nip7Q9CXK8 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nip7Q9CXK8 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nip7Q9CXK8 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nip7Q9CXK8 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Nip7Q9CXK8 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nip7Q9CXK8 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Nip7Q9CXK8 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Nip7Q9CXK8 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nip7Q9CXK8 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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