Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Slc22a13-201ENSMUST00000084797 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Tom1l2-204ENSMUST00000095254 4940 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Zbtb21-203ENSMUST00000113734 6010 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
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