Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms