Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW1

Ykt6, Synaptobrevin homolog YKT6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ykt6Q9CQW1 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ykt6Q9CQW1 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ykt6Q9CQW1 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ykt6Q9CQW1 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ykt6Q9CQW1 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ykt6Q9CQW1 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ykt6Q9CQW1 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ykt6Q9CQW1 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ykt6Q9CQW1 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ykt6Q9CQW1 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ykt6Q9CQW1 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ykt6Q9CQW1 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ykt6Q9CQW1 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ykt6Q9CQW1 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ykt6Q9CQW1 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ykt6Q9CQW1 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ykt6Q9CQW1 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ykt6Q9CQW1 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ykt6Q9CQW1 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ykt6Q9CQW1 Esr2-202ENSMUST00000101291 3362 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ykt6Q9CQW1 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ykt6Q9CQW1 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ykt6Q9CQW1 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ykt6Q9CQW1 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ykt6Q9CQW1 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ykt6Q9CQW1 4732490B19Rik-201ENSMUST00000130373 2446 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ykt6Q9CQW1 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ykt6Q9CQW1 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ykt6Q9CQW1 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ykt6Q9CQW1 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ykt6Q9CQW1 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ykt6Q9CQW1 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ykt6Q9CQW1 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ykt6Q9CQW1 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ykt6Q9CQW1 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ykt6Q9CQW1 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ykt6Q9CQW1 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ykt6Q9CQW1 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ykt6Q9CQW1 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ykt6Q9CQW1 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ykt6Q9CQW1 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ykt6Q9CQW1 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ykt6Q9CQW1 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ykt6Q9CQW1 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ykt6Q9CQW1 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ykt6Q9CQW1 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ykt6Q9CQW1 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ykt6Q9CQW1 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ykt6Q9CQW1 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ykt6Q9CQW1 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ykt6Q9CQW1 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ykt6Q9CQW1 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ykt6Q9CQW1 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ykt6Q9CQW1 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ykt6Q9CQW1 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ykt6Q9CQW1 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ykt6Q9CQW1 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ykt6Q9CQW1 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ykt6Q9CQW1 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ykt6Q9CQW1 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ykt6Q9CQW1 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ykt6Q9CQW1 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ykt6Q9CQW1 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ykt6Q9CQW1 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ykt6Q9CQW1 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ykt6Q9CQW1 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ykt6Q9CQW1 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ykt6Q9CQW1 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ykt6Q9CQW1 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ykt6Q9CQW1 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ykt6Q9CQW1 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ykt6Q9CQW1 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ykt6Q9CQW1 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ykt6Q9CQW1 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ykt6Q9CQW1 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ykt6Q9CQW1 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ykt6Q9CQW1 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ykt6Q9CQW1 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ykt6Q9CQW1 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ykt6Q9CQW1 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ykt6Q9CQW1 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ykt6Q9CQW1 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ykt6Q9CQW1 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ykt6Q9CQW1 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ykt6Q9CQW1 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ykt6Q9CQW1 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ykt6Q9CQW1 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ykt6Q9CQW1 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ykt6Q9CQW1 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ykt6Q9CQW1 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ykt6Q9CQW1 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ykt6Q9CQW1 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ykt6Q9CQW1 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ykt6Q9CQW1 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ykt6Q9CQW1 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ykt6Q9CQW1 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ykt6Q9CQW1 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ykt6Q9CQW1 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ykt6Q9CQW1 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ykt6Q9CQW1 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms