Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ8

Ndufb9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb9Q9CQJ8 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ndufb9Q9CQJ8 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ndufb9Q9CQJ8 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Ndufb9Q9CQJ8 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Ndufb9Q9CQJ8 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Ndufb9Q9CQJ8 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Ndufb9Q9CQJ8 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Ndufb9Q9CQJ8 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ndufb9Q9CQJ8 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ndufb9Q9CQJ8 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Ndufb9Q9CQJ8 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ndufb9Q9CQJ8 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Ndufb9Q9CQJ8 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Ndufb9Q9CQJ8 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Ndufb9Q9CQJ8 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Ndufb9Q9CQJ8 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ndufb9Q9CQJ8 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ndufb9Q9CQJ8 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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