Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF3

Nudt21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt21Q9CQF3 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Nudt21Q9CQF3 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms