Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
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Atp6v0e1Q9CQD8 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
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Atp6v0e1Q9CQD8 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
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Atp6v0e1Q9CQD8 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
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Atp6v0e1Q9CQD8 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
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Atp6v0e1Q9CQD8 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Atp6v0e1Q9CQD8 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Atp6v0e1Q9CQD8 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Atp6v0e1Q9CQD8 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Atp6v0e1Q9CQD8 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
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Atp6v0e1Q9CQD8 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
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Atp6v0e1Q9CQD8 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Atp6v0e1Q9CQD8 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Atp6v0e1Q9CQD8 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
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Atp6v0e1Q9CQD8 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
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