Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ02

Commd4, COMM domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd4Q9CQ02 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 Nhsl1-201ENSMUST00000037341 7321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 Bcl9l-203ENSMUST00000218183 6771 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Commd4Q9CQ02 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms