Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

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Length 314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg3Q9CPX6 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg3Q9CPX6 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg3Q9CPX6 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg3Q9CPX6 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg3Q9CPX6 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg3Q9CPX6 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg3Q9CPX6 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg3Q9CPX6 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg3Q9CPX6 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg3Q9CPX6 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg3Q9CPX6 Gm16081-201ENSMUST00000155992 684 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg3Q9CPX6 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg3Q9CPX6 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg3Q9CPX6 Gm43001-201ENSMUST00000198925 603 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg3Q9CPX6 Gm35713-201ENSMUST00000210516 199 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg3Q9CPX6 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg3Q9CPX6 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg3Q9CPX6 Gm25201-201ENSMUST00000083093 170 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg3Q9CPX6 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg3Q9CPX6 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg3Q9CPX6 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg3Q9CPX6 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg3Q9CPX6 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg3Q9CPX6 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg3Q9CPX6 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg3Q9CPX6 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg3Q9CPX6 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg3Q9CPX6 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg3Q9CPX6 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg3Q9CPX6 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg3Q9CPX6 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg3Q9CPX6 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg3Q9CPX6 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg3Q9CPX6 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg3Q9CPX6 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg3Q9CPX6 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg3Q9CPX6 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg3Q9CPX6 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg3Q9CPX6 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg3Q9CPX6 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg3Q9CPX6 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg3Q9CPX6 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg3Q9CPX6 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg3Q9CPX6 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Atg3Q9CPX6 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg3Q9CPX6 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg3Q9CPX6 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg3Q9CPX6 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg3Q9CPX6 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Atg3Q9CPX6 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg3Q9CPX6 Rhox3d-ps-201ENSMUST00000119181 825 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg3Q9CPX6 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Atg3Q9CPX6 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg3Q9CPX6 Gm5544-201ENSMUST00000098828 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Atg3Q9CPX6 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg3Q9CPX6 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg3Q9CPX6 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg3Q9CPX6 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg3Q9CPX6 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atg3Q9CPX6 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atg3Q9CPX6 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atg3Q9CPX6 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atg3Q9CPX6 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atg3Q9CPX6 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atg3Q9CPX6 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atg3Q9CPX6 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atg3Q9CPX6 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atg3Q9CPX6 Rhox3c-202ENSMUST00000115189 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atg3Q9CPX6 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Atg3Q9CPX6 Churc1-203ENSMUST00000126408 462 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atg3Q9CPX6 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atg3Q9CPX6 Taar8c-201ENSMUST00000170267 1035 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atg3Q9CPX6 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Atg3Q9CPX6 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atg3Q9CPX6 Rhox3a2-204ENSMUST00000184565 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atg3Q9CPX6 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Atg3Q9CPX6 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atg3Q9CPX6 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Atg3Q9CPX6 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Atg3Q9CPX6 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atg3Q9CPX6 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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