Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV8

Bcl11b, B-cell lymphoma/leukemia 11B, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcl11bQ99PV8 2410152P15Rik-201ENSMUST00000137405 871 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bcl11bQ99PV8 Snhg3-202ENSMUST00000141090 581 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Bcl11bQ99PV8 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bcl11bQ99PV8 Plet1os-202ENSMUST00000190941 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bcl11bQ99PV8 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Bcl11bQ99PV8 Gm43244-201ENSMUST00000196994 1285 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Bcl11bQ99PV8 Gm39091-201ENSMUST00000206189 553 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Bcl11bQ99PV8 Ywhaq-ps1-201ENSMUST00000206623 710 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Bcl11bQ99PV8 4933402C05Rik-201ENSMUST00000208189 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bcl11bQ99PV8 Map7-203ENSMUST00000213312 795 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bcl11bQ99PV8 Gm8255-201ENSMUST00000218693 305 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Bcl11bQ99PV8 Nutf2-ps1-201ENSMUST00000095978 864 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Bcl11bQ99PV8 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bcl11bQ99PV8 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Bcl11bQ99PV8 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bcl11bQ99PV8 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bcl11bQ99PV8 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Bcl11bQ99PV8 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bcl11bQ99PV8 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bcl11bQ99PV8 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Bcl11bQ99PV8 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bcl11bQ99PV8 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bcl11bQ99PV8 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bcl11bQ99PV8 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bcl11bQ99PV8 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bcl11bQ99PV8 Gm8369-201ENSMUST00000079855 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Bcl11bQ99PV8 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bcl11bQ99PV8 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bcl11bQ99PV8 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bcl11bQ99PV8 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bcl11bQ99PV8 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bcl11bQ99PV8 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bcl11bQ99PV8 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bcl11bQ99PV8 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bcl11bQ99PV8 Rptoros-201ENSMUST00000127450 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bcl11bQ99PV8 Glrx2-206ENSMUST00000145969 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bcl11bQ99PV8 Chn2-209ENSMUST00000146114 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bcl11bQ99PV8 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Bcl11bQ99PV8 Tcl1b5-201ENSMUST00000000717 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bcl11bQ99PV8 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bcl11bQ99PV8 Zc2hc1a-203ENSMUST00000193010 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bcl11bQ99PV8 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bcl11bQ99PV8 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bcl11bQ99PV8 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bcl11bQ99PV8 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bcl11bQ99PV8 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bcl11bQ99PV8 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bcl11bQ99PV8 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bcl11bQ99PV8 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bcl11bQ99PV8 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bcl11bQ99PV8 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bcl11bQ99PV8 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bcl11bQ99PV8 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bcl11bQ99PV8 Hist1h4i-201ENSMUST00000102977 727 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bcl11bQ99PV8 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bcl11bQ99PV8 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bcl11bQ99PV8 Tmem181c-ps-201ENSMUST00000115772 1288 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Bcl11bQ99PV8 Gm12439-201ENSMUST00000117162 365 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Bcl11bQ99PV8 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Bcl11bQ99PV8 Gm8152-201ENSMUST00000120842 637 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Bcl11bQ99PV8 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bcl11bQ99PV8 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bcl11bQ99PV8 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bcl11bQ99PV8 Gm9372-201ENSMUST00000168454 430 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Bcl11bQ99PV8 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bcl11bQ99PV8 Cd9-ps-201ENSMUST00000174687 650 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Bcl11bQ99PV8 Gm27826-201ENSMUST00000175282 255 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Bcl11bQ99PV8 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Bcl11bQ99PV8 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Bcl11bQ99PV8 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bcl11bQ99PV8 Klk1b15-ps-201ENSMUST00000206273 715 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Bcl11bQ99PV8 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bcl11bQ99PV8 Gm7525-201ENSMUST00000219425 454 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Bcl11bQ99PV8 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Bcl11bQ99PV8 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bcl11bQ99PV8 Pgk1-rs7-201ENSMUST00000085735 1255 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Bcl11bQ99PV8 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bcl11bQ99PV8 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bcl11bQ99PV8 Stxbp4-203ENSMUST00000107875 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bcl11bQ99PV8 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bcl11bQ99PV8 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bcl11bQ99PV8 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bcl11bQ99PV8 Gnat3-201ENSMUST00000030561 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bcl11bQ99PV8 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bcl11bQ99PV8 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bcl11bQ99PV8 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bcl11bQ99PV8 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bcl11bQ99PV8 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bcl11bQ99PV8 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bcl11bQ99PV8 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bcl11bQ99PV8 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bcl11bQ99PV8 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bcl11bQ99PV8 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bcl11bQ99PV8 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bcl11bQ99PV8 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bcl11bQ99PV8 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bcl11bQ99PV8 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Bcl11bQ99PV8 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bcl11bQ99PV8 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bcl11bQ99PV8 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms