Protein–RNA interactions for Protein: Q99N07

Ms4a6d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6D, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a6dQ99N07 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ms4a6dQ99N07 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ms4a6dQ99N07 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ms4a6dQ99N07 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ms4a6dQ99N07 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Ms4a6dQ99N07 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ms4a6dQ99N07 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ms4a6dQ99N07 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Ms4a6dQ99N07 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ms4a6dQ99N07 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ms4a6dQ99N07 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ms4a6dQ99N07 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ms4a6dQ99N07 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ms4a6dQ99N07 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ms4a6dQ99N07 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Ms4a6dQ99N07 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ms4a6dQ99N07 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ms4a6dQ99N07 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ms4a6dQ99N07 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ms4a6dQ99N07 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ms4a6dQ99N07 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ms4a6dQ99N07 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ms4a6dQ99N07 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ms4a6dQ99N07 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ms4a6dQ99N07 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ms4a6dQ99N07 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ms4a6dQ99N07 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ms4a6dQ99N07 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ms4a6dQ99N07 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ms4a6dQ99N07 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ms4a6dQ99N07 Gm11298-201ENSMUST00000120503 1799 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Ms4a6dQ99N07 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ms4a6dQ99N07 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ms4a6dQ99N07 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ms4a6dQ99N07 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ms4a6dQ99N07 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ms4a6dQ99N07 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ms4a6dQ99N07 Anks1b-216ENSMUST00000182430 3305 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ms4a6dQ99N07 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ms4a6dQ99N07 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ms4a6dQ99N07 Olfr1495-203ENSMUST00000216980 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ms4a6dQ99N07 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ms4a6dQ99N07 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ms4a6dQ99N07 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ms4a6dQ99N07 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ms4a6dQ99N07 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ms4a6dQ99N07 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ms4a6dQ99N07 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ms4a6dQ99N07 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ms4a6dQ99N07 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ms4a6dQ99N07 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ms4a6dQ99N07 4930488L21Rik-202ENSMUST00000212638 3164 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ms4a6dQ99N07 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ms4a6dQ99N07 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ms4a6dQ99N07 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ms4a6dQ99N07 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ms4a6dQ99N07 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ms4a6dQ99N07 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Ms4a6dQ99N07 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Ms4a6dQ99N07 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ms4a6dQ99N07 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Ms4a6dQ99N07 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Ms4a6dQ99N07 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ms4a6dQ99N07 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ms4a6dQ99N07 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ms4a6dQ99N07 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ms4a6dQ99N07 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ms4a6dQ99N07 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ms4a6dQ99N07 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Ms4a6dQ99N07 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Ms4a6dQ99N07 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ms4a6dQ99N07 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ms4a6dQ99N07 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ms4a6dQ99N07 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ms4a6dQ99N07 Plekhg5-203ENSMUST00000105662 3933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ms4a6dQ99N07 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ms4a6dQ99N07 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ms4a6dQ99N07 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Ms4a6dQ99N07 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ms4a6dQ99N07 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Ms4a6dQ99N07 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ms4a6dQ99N07 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ms4a6dQ99N07 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ms4a6dQ99N07 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ms4a6dQ99N07 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ms4a6dQ99N07 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ms4a6dQ99N07 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ms4a6dQ99N07 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ms4a6dQ99N07 Ing3-202ENSMUST00000115389 2546 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ms4a6dQ99N07 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ms4a6dQ99N07 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ms4a6dQ99N07 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ms4a6dQ99N07 Palld-201ENSMUST00000034057 3566 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ms4a6dQ99N07 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ms4a6dQ99N07 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ms4a6dQ99N07 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ms4a6dQ99N07 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ms4a6dQ99N07 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ms4a6dQ99N07 8030423F21Rik-201ENSMUST00000064097 2851 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ms4a6dQ99N07 1700019J19Rik-205ENSMUST00000216531 2813 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms