Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV1

Tdrd1, Tudor domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd1Q99MV1 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms