Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SrrtQ99MR6 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
SrrtQ99MR6 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SrrtQ99MR6 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SrrtQ99MR6 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SrrtQ99MR6 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SrrtQ99MR6 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 CT009738.1-201ENSMUST00000219031 809 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SrrtQ99MR6 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.5 ms