Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp1b4Q99ME6 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp1b4Q99ME6 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp1b4Q99ME6 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp1b4Q99ME6 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp1b4Q99ME6 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp1b4Q99ME6 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp1b4Q99ME6 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp1b4Q99ME6 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp1b4Q99ME6 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp1b4Q99ME6 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp1b4Q99ME6 Bach2os-202ENSMUST00000136149 687 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp1b4Q99ME6 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp1b4Q99ME6 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp1b4Q99ME6 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp1b4Q99ME6 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp1b4Q99ME6 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp1b4Q99ME6 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp1b4Q99ME6 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp1b4Q99ME6 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp1b4Q99ME6 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp1b4Q99ME6 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp1b4Q99ME6 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp1b4Q99ME6 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp1b4Q99ME6 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp1b4Q99ME6 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp1b4Q99ME6 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp1b4Q99ME6 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp1b4Q99ME6 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp1b4Q99ME6 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp1b4Q99ME6 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp1b4Q99ME6 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp1b4Q99ME6 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp1b4Q99ME6 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp1b4Q99ME6 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp1b4Q99ME6 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp1b4Q99ME6 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp1b4Q99ME6 Asgr1-205ENSMUST00000146411 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp1b4Q99ME6 Gm16271-201ENSMUST00000162837 220 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp1b4Q99ME6 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp1b4Q99ME6 Gm29083-201ENSMUST00000189205 733 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp1b4Q99ME6 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp1b4Q99ME6 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp1b4Q99ME6 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp1b4Q99ME6 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp1b4Q99ME6 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp1b4Q99ME6 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp1b4Q99ME6 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp1b4Q99ME6 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp1b4Q99ME6 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp1b4Q99ME6 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp1b4Q99ME6 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp1b4Q99ME6 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp1b4Q99ME6 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp1b4Q99ME6 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp1b4Q99ME6 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp1b4Q99ME6 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp1b4Q99ME6 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp1b4Q99ME6 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp1b4Q99ME6 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp1b4Q99ME6 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp1b4Q99ME6 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp1b4Q99ME6 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp1b4Q99ME6 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp1b4Q99ME6 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp1b4Q99ME6 Churc1-203ENSMUST00000126408 462 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp1b4Q99ME6 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp1b4Q99ME6 Gm35713-201ENSMUST00000210516 199 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp1b4Q99ME6 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp1b4Q99ME6 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp1b4Q99ME6 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp1b4Q99ME6 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp1b4Q99ME6 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp1b4Q99ME6 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp1b4Q99ME6 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp1b4Q99ME6 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp1b4Q99ME6 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp1b4Q99ME6 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp1b4Q99ME6 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp1b4Q99ME6 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp1b4Q99ME6 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp1b4Q99ME6 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Atp1b4Q99ME6 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Atp1b4Q99ME6 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Atp1b4Q99ME6 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Atp1b4Q99ME6 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Atp1b4Q99ME6 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Atp1b4Q99ME6 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Gm13609-201ENSMUST00000141023 589 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Pbld1-206ENSMUST00000219687 788 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Gm46204-201ENSMUST00000219800 411 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms