Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtprtQ99M80 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtprtQ99M80 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtprtQ99M80 Gm29521-201ENSMUST00000187061 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtprtQ99M80 Gm8828-201ENSMUST00000196786 1290 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PtprtQ99M80 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtprtQ99M80 Gm44420-201ENSMUST00000203669 490 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PtprtQ99M80 AC133517.1-201ENSMUST00000225825 594 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PtprtQ99M80 Ccl25-201ENSMUST00000024004 1058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtprtQ99M80 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtprtQ99M80 Olfr115-201ENSMUST00000076936 939 ntAPPRIS P2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtprtQ99M80 Gm22341-201ENSMUST00000083775 129 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PtprtQ99M80 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtprtQ99M80 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtprtQ99M80 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtprtQ99M80 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtprtQ99M80 Gm38246-201ENSMUST00000194318 1511 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PtprtQ99M80 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtprtQ99M80 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtprtQ99M80 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtprtQ99M80 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtprtQ99M80 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtprtQ99M80 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PtprtQ99M80 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PtprtQ99M80 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PtprtQ99M80 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PtprtQ99M80 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PtprtQ99M80 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PtprtQ99M80 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PtprtQ99M80 4933438A12Rik-201ENSMUST00000144579 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PtprtQ99M80 Gm2663-201ENSMUST00000166306 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PtprtQ99M80 Rab26-204ENSMUST00000176533 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PtprtQ99M80 Rps4l-ps-201ENSMUST00000059737 768 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PtprtQ99M80 Cdip1-202ENSMUST00000117713 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PtprtQ99M80 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PtprtQ99M80 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PtprtQ99M80 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PtprtQ99M80 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PtprtQ99M80 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PtprtQ99M80 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PtprtQ99M80 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PtprtQ99M80 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PtprtQ99M80 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PtprtQ99M80 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PtprtQ99M80 Lims1-201ENSMUST00000020077 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PtprtQ99M80 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PtprtQ99M80 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PtprtQ99M80 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PtprtQ99M80 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PtprtQ99M80 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 Impdh2-ps-201ENSMUST00000120826 1545 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 Hint1-202ENSMUST00000117710 580 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 Gm13580-201ENSMUST00000131457 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 2810403D21Rik-204ENSMUST00000144421 747 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 Gm44540-201ENSMUST00000205640 354 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 Fxyd7-202ENSMUST00000206341 620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 AC122024.3-201ENSMUST00000217719 294 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 Fxyd7-201ENSMUST00000073892 693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 Olfr601-203ENSMUST00000214110 2196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 Olfr601-204ENSMUST00000217416 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 Ifna5-201ENSMUST00000102804 570 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 Gm7781-201ENSMUST00000117258 788 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 Gm16165-201ENSMUST00000160140 795 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 Gm5873-201ENSMUST00000177157 1066 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 Gm37597-201ENSMUST00000191853 382 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 Gm44498-201ENSMUST00000199509 111 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 Gm35611-201ENSMUST00000205323 799 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 AC164429.1-201ENSMUST00000224210 518 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 Npl-201ENSMUST00000041874 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprtQ99M80 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms