Protein–RNA interactions for Protein: Q99LF4

Rtcb, tRNA-splicing ligase RtcB homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RtcbQ99LF4 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Smim20-201ENSMUST00000147148 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Zfp655-203ENSMUST00000196069 1150 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Gm30978-201ENSMUST00000211581 1066 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Slc38a5-203ENSMUST00000115591 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Hddc3-201ENSMUST00000032747 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Art5-202ENSMUST00000106934 843 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Gm12791-201ENSMUST00000120788 655 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Gm11884-201ENSMUST00000131639 641 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 1700123M08Rik-202ENSMUST00000146154 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Gm17214-201ENSMUST00000164501 541 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 B230110C06Rik-201ENSMUST00000181388 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Gm9081-201ENSMUST00000182346 991 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Gm18776-201ENSMUST00000188833 654 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Zmiz1os1-202ENSMUST00000225188 1223 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Prss3-201ENSMUST00000096003 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Gm5641-201ENSMUST00000091130 1488 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Mir671-201ENSMUST00000102432 98 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Gm11578-201ENSMUST00000118530 459 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Gm6322-201ENSMUST00000118789 1004 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Gm9673-201ENSMUST00000119287 781 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Gm45716-203ENSMUST00000153734 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Gm15524-201ENSMUST00000159874 463 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Gm17192-201ENSMUST00000169031 511 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Gm7719-201ENSMUST00000182374 975 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 C230057A21Rik-202ENSMUST00000195781 600 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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