Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TrabdQ99JY4 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TrabdQ99JY4 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TrabdQ99JY4 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TrabdQ99JY4 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
TrabdQ99JY4 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TrabdQ99JY4 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TrabdQ99JY4 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TrabdQ99JY4 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TrabdQ99JY4 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TrabdQ99JY4 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TrabdQ99JY4 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TrabdQ99JY4 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TrabdQ99JY4 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TrabdQ99JY4 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TrabdQ99JY4 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TrabdQ99JY4 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
TrabdQ99JY4 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TrabdQ99JY4 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TrabdQ99JY4 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TrabdQ99JY4 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TrabdQ99JY4 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TrabdQ99JY4 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TrabdQ99JY4 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
TrabdQ99JY4 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
TrabdQ99JY4 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TrabdQ99JY4 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
TrabdQ99JY4 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
TrabdQ99JY4 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TrabdQ99JY4 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TrabdQ99JY4 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
TrabdQ99JY4 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TrabdQ99JY4 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
TrabdQ99JY4 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TrabdQ99JY4 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
TrabdQ99JY4 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TrabdQ99JY4 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TrabdQ99JY4 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TrabdQ99JY4 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TrabdQ99JY4 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
TrabdQ99JY4 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TrabdQ99JY4 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
TrabdQ99JY4 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TrabdQ99JY4 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
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TrabdQ99JY4 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
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TrabdQ99JY4 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
TrabdQ99JY4 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
TrabdQ99JY4 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
TrabdQ99JY4 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
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TrabdQ99JY4 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
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TrabdQ99JY4 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
TrabdQ99JY4 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
TrabdQ99JY4 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
TrabdQ99JY4 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
TrabdQ99JY4 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
TrabdQ99JY4 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
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TrabdQ99JY4 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
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TrabdQ99JY4 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
TrabdQ99JY4 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TrabdQ99JY4 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
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TrabdQ99JY4 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TrabdQ99JY4 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
TrabdQ99JY4 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TrabdQ99JY4 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TrabdQ99JY4 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
TrabdQ99JY4 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TrabdQ99JY4 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
TrabdQ99JY4 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TrabdQ99JY4 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TrabdQ99JY4 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TrabdQ99JY4 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TrabdQ99JY4 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TrabdQ99JY4 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TrabdQ99JY4 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TrabdQ99JY4 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TrabdQ99JY4 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
TrabdQ99JY4 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TrabdQ99JY4 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
TrabdQ99JY4 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
TrabdQ99JY4 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
TrabdQ99JY4 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
TrabdQ99JY4 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TrabdQ99JY4 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
TrabdQ99JY4 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
TrabdQ99JY4 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.3 ms