Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb2Q99J79 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms