Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 4631405J19Rik-201ENSMUST00000099699 1225 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Csmd1Q923L3 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Csmd1Q923L3 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Csmd1Q923L3 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Csmd1Q923L3 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Csmd1Q923L3 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Csmd1Q923L3 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Csmd1Q923L3 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Csmd1Q923L3 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Csmd1Q923L3 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Csmd1Q923L3 Gm6741-201ENSMUST00000057074 1330 ntAPPRIS P1 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Csmd1Q923L3 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Csmd1Q923L3 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Csmd1Q923L3 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Csmd1Q923L3 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Csmd1Q923L3 Hist1h4i-201ENSMUST00000102977 727 ntAPPRIS P1 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Csmd1Q923L3 Gm22661-201ENSMUST00000104192 132 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Csmd1Q923L3 St8sia3os-204ENSMUST00000140903 383 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Csmd1Q923L3 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Csmd1Q923L3 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Csmd1Q923L3 Olfr1015-201ENSMUST00000047870 1016 ntAPPRIS P1 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Csmd1Q923L3 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Csmd1Q923L3 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Csmd1Q923L3 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Csmd1Q923L3 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Csmd1Q923L3 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Csmd1Q923L3 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Csmd1Q923L3 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Csmd1Q923L3 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Csmd1Q923L3 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Csmd1Q923L3 Snx27-208ENSMUST00000200642 1308 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Csmd1Q923L3 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Csmd1Q923L3 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Csmd1Q923L3 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Csmd1Q923L3 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Csmd1Q923L3 Gm23132-201ENSMUST00000104254 132 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Csmd1Q923L3 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Csmd1Q923L3 Gm8226-201ENSMUST00000190511 798 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Csmd1Q923L3 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Csmd1Q923L3 Gm18035-201ENSMUST00000211962 589 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Csmd1Q923L3 Gm9487-201ENSMUST00000216600 472 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Csmd1Q923L3 Gm12248-203ENSMUST00000219877 1160 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Csmd1Q923L3 AC159261.1-201ENSMUST00000222493 911 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Csmd1Q923L3 AC154477.1-201ENSMUST00000226515 773 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Csmd1Q923L3 AC137842.2-201ENSMUST00000227734 797 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Csmd1Q923L3 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Csmd1Q923L3 Olfr669-201ENSMUST00000098164 954 ntAPPRIS P1 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Csmd1Q923L3 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Csmd1Q923L3 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Csmd1Q923L3 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Csmd1Q923L3 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Csmd1Q923L3 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Csmd1Q923L3 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Csmd1Q923L3 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Csmd1Q923L3 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Csmd1Q923L3 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Csmd1Q923L3 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Csmd1Q923L3 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Csmd1Q923L3 5033404E19Rik-202ENSMUST00000194748 1065 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Csmd1Q923L3 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Csmd1Q923L3 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Csmd1Q923L3 Gm18124-201ENSMUST00000210695 706 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Csmd1Q923L3 Myl6-203ENSMUST00000217776 562 ntTSL 3 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Csmd1Q923L3 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Csmd1Q923L3 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Csmd1Q923L3 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Csmd1Q923L3 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Csmd1Q923L3 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Csmd1Q923L3 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Csmd1Q923L3 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Csmd1Q923L3 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Csmd1Q923L3 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Csmd1Q923L3 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Csmd1Q923L3 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Csmd1Q923L3 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Csmd1Q923L3 Gm12345-201ENSMUST00000119288 898 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Csmd1Q923L3 Gm8019-201ENSMUST00000119317 587 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Csmd1Q923L3 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Csmd1Q923L3 AC155709.2-201ENSMUST00000219360 678 ntTSL 3 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Csmd1Q923L3 AC122840.4-201ENSMUST00000221310 1285 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Csmd1Q923L3 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Csmd1Q923L3 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Csmd1Q923L3 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Csmd1Q923L3 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Csmd1Q923L3 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Csmd1Q923L3 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Csmd1Q923L3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Csmd1Q923L3 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Csmd1Q923L3 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Csmd1Q923L3 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Csmd1Q923L3 Sh3gl2-202ENSMUST00000107184 671 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Csmd1Q923L3 Trub2-203ENSMUST00000113807 1035 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Csmd1Q923L3 Gm4943-201ENSMUST00000132879 424 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Csmd1Q923L3 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Csmd1Q923L3 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Csmd1Q923L3 Rpl9-201ENSMUST00000057885 738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Csmd1Q923L3 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Csmd1Q923L3 Eef1akmt4-202ENSMUST00000119224 1464 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Csmd1Q923L3 Txndc9-208ENSMUST00000195247 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Csmd1Q923L3 Brcc3-203ENSMUST00000118428 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms