Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC5

Cabp4, Calcium-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp4Q8VHC5 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cabp4Q8VHC5 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cabp4Q8VHC5 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cabp4Q8VHC5 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cabp4Q8VHC5 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cabp4Q8VHC5 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cabp4Q8VHC5 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cabp4Q8VHC5 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cabp4Q8VHC5 2310074N15Rik-201ENSMUST00000198276 582 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cabp4Q8VHC5 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cabp4Q8VHC5 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cabp4Q8VHC5 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cabp4Q8VHC5 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cabp4Q8VHC5 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cabp4Q8VHC5 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cabp4Q8VHC5 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cabp4Q8VHC5 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cabp4Q8VHC5 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cabp4Q8VHC5 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cabp4Q8VHC5 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cabp4Q8VHC5 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cabp4Q8VHC5 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cabp4Q8VHC5 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cabp4Q8VHC5 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cabp4Q8VHC5 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cabp4Q8VHC5 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cabp4Q8VHC5 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cabp4Q8VHC5 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cabp4Q8VHC5 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cabp4Q8VHC5 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cabp4Q8VHC5 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cabp4Q8VHC5 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cabp4Q8VHC5 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cabp4Q8VHC5 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cabp4Q8VHC5 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cabp4Q8VHC5 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cabp4Q8VHC5 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cabp4Q8VHC5 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cabp4Q8VHC5 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cabp4Q8VHC5 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cabp4Q8VHC5 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cabp4Q8VHC5 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cabp4Q8VHC5 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cabp4Q8VHC5 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cabp4Q8VHC5 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cabp4Q8VHC5 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cabp4Q8VHC5 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cabp4Q8VHC5 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cabp4Q8VHC5 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cabp4Q8VHC5 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cabp4Q8VHC5 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cabp4Q8VHC5 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cabp4Q8VHC5 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cabp4Q8VHC5 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cabp4Q8VHC5 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cabp4Q8VHC5 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cabp4Q8VHC5 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cabp4Q8VHC5 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cabp4Q8VHC5 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cabp4Q8VHC5 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cabp4Q8VHC5 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cabp4Q8VHC5 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cabp4Q8VHC5 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cabp4Q8VHC5 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cabp4Q8VHC5 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cabp4Q8VHC5 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cabp4Q8VHC5 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cabp4Q8VHC5 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cabp4Q8VHC5 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cabp4Q8VHC5 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cabp4Q8VHC5 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cabp4Q8VHC5 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cabp4Q8VHC5 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cabp4Q8VHC5 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cabp4Q8VHC5 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cabp4Q8VHC5 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cabp4Q8VHC5 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cabp4Q8VHC5 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cabp4Q8VHC5 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cabp4Q8VHC5 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cabp4Q8VHC5 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cabp4Q8VHC5 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cabp4Q8VHC5 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cabp4Q8VHC5 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cabp4Q8VHC5 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cabp4Q8VHC5 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cabp4Q8VHC5 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cabp4Q8VHC5 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cabp4Q8VHC5 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cabp4Q8VHC5 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cabp4Q8VHC5 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cabp4Q8VHC5 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cabp4Q8VHC5 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cabp4Q8VHC5 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cabp4Q8VHC5 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cabp4Q8VHC5 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cabp4Q8VHC5 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cabp4Q8VHC5 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cabp4Q8VHC5 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cabp4Q8VHC5 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms