Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Zcwpw2-202ENSMUST00000187329 1469 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.8 ms